La empresa Puerto de Cruceros Colón 2000, S.A. inicia operaciones en octubre del año 2000 con una terminal, en la actualidad corresponde a la terminal No 1, el principal objetivo es prestar servicios a los cruceros en viajes internacionales.

​En febrero del año 2008 la empresa amplió y mejoró el servicio para los cruceros con la construcción de la segunda terminal, actualmente corresponde a la terminal No 2, más conocida con el nombre de “Home Port” de cruceros, brindando de esta forma la oportunidad de realizar cruceros por el caribe a los pasajeros provenientes de América Latina. El “Home port” de cruceros inicia sus operaciones el 8 de diciembre de 2008 con la salida del crucero “Enchantment of the Seas” de la empresa Royal Caribbean International.

​El Puerto de Cruceros Colón 2000, S.A. y plaza Colón 2000 está construido en una superficie de unos 70.000 m2 aproximadamente, cuenta con; dos terminales de 100 y 200 metros de largo, estacionamientos, una sala de embarque para pasajeros, tiendas “Duty free”, y un sector destinado al manejo de carga en general. Y a partir de mayo del año 2016 entra en operación el área de muelle destinado para Lanchas comerciales, disponiendo de 12 espacios para embarcaciones de hasta 60 pies de eslora.

​Con el objetivo de incrementar la oferta turística en la ciudad de Colón, se está construyendo el mall “Colón 2000 Duty Free” que estará ubicado en la zona más turística, moderna y segura en la ciudad de Colón y comprenderá a 25 mil m2 destinados a locales comerciales.